Вірус гепатиту B (HBV) входить до родини Hepadnaviridae. Вірусна частинка, (віріон) складається з зовнішньої ліпідної оболонки та ікосаедричного внутрішнього нуклеокапсиду що складається з білків.

Віріони мають діаметр 42 нм, і часом називаються «Частинками Дейна». Нуклеокапсид містить вірусну ДНК, та ДНК-полімеразу яка може виконувати зворотню транскрипцію. Зовнішня оболонка також містить вбудовані білки які беруть участь в прив’язуванні, та проникненні в сприйнятливі клітини. Цей вірус є одним з найменших оболонкових вірусів тварин, але існують плеоморфні форми, що включають філаментні та сферичні тіла з відсутнім ядром. Ці частинки не є заразними і складаються з ліпідів та білка що формують поверхню віріона, яка називаається поверхневим антигеном, і протягом життєвого циклу вірусу виробляється у надлишку.