Хлоропласти — одні з унікальних структур в організмі рослини і, як загалом вважається, виникли в результаті ендосимбіозу від ціанобактерій. У цьому відношенні вони подібні до мітохондрій, але знайдені тільки в рослинах та найпростіших. Обидві органели оточені складною подвійною мембраною з міжмембранним простором, мають свою власну ДНК і залучені до енергетичного метаболізму, обидві мають багато виступів на своїй внутрішній мембрані.

У багатьох клітин грибів є клітинна стінка. Відсутня вона лише у зооспор і вегетативних клітин деяких примітивних грибів. На 80-90% вона складається з азотистих і безазотистих полісахаридів, у більшості основних полисахаридом є хітин, у оомицетов — целюлоза. Також до складу клітинної стінки входять білки, ліпіди і поліфосфати. Всередині знаходиться протопласт, оточений цитоплазматичної мембраною. Протопласт має будову що є типовою для еукаріот. Є запасаючі вакуолі, що містять волютин, ліпіди, глікоген, жирні кислоти (в основному ненасичені) і інші речовини. Ядер одне або кілька. У різних груп переважають різні стадії по плоїдності.

Бактерії, незважаючи на їх очевидну простоту, мають добре розвинену структуру клітини, яка відповідає за багато їх унікальних біологічних властивостей. Багато конструктивних деталей унікальні для бактерій і не знайдені серед архей або еукаріотів. Проте, незважаючи на відносну простоту бактерій і легкість вирощування окремих штамів, багато бактерій не вдається виростити в лабораторних умовах, а їх структури часто занадто малі для вивчення. Тому, хоча деякі принципи будови бактеріальної клітини добре вивчені та навіть застосовуються для інших організмів, більшість унікальних рис та структур бактерій все ще невідомі.

Особливостi, характернi саме для рослинної клiтини: наявнiсть клiтинної стiнки з целюлози, наявнiсть пластид, великої вакуолi, заповненої клiтинним соком та накопичення крохмалю.

Тваринна клітина мас тоненьку клітинну стінку (глікокалікс), часто здатна до поглинання твердих часток (фагоцитозу), не має хлоропластів і вакуолей із клітинним соком.